A partir du 29 janvier 2010, alors que la diffusion télé n'est pas encore finie, sort au Japon le premier DVD de la série animée Kobato. Il en sortira au total 12.
Chaque DVD se verra décliner dans une édition simple et dans une édition collector présentant plusieurs bonus, et des petits goodies.
De plus, la sortie du premier DVD et du septième sera accompagnée de la vente d'un coffret. Ces deux coffrets permettent au collectionneur de pouvoir ranger respectivement les 6 premiers DVD dans un box aux couleurs du printemps et de l'été, et les 6 derniers dans un box aux couleurs de l'automne et de l'hivers, symbolisant l'année passée sur Terre par Kobato Hanato.
Les DVD Collector se voit accompagné de divers goodies, comme une étiquette de la forme du logo de la série (au dessus) à accrocher à son sac, une petite peluche de Ioryogi (ci-contre), mais encore des stickers, des livrets, des illustrations, ou des CD sur lesquels figurent des petits drama.
De plus, les détenteurs des six premiers volumes avaient la possibilité, dans la limite des stocks disponibles, d'obtenir la fameuse Bouteille de verre de Kobato.
Contenu de la Blu-ray box Kobato
Le 30 mars 2012 voit la réédition de la série Kobato, cette fois en Blu-ray. La série sort directement en box de 4 Blu-ray de 6 épisodes chacun, accompagné d'une série de 12 cartes postales, d'un livret-artbook couleur de 20 pages et d'un CD reprenant les dramas bonus de la version collector DVD.
Liste des DVD[]
| DVD | Couverture | Date de sortie japonais |
| 1 |  |
29/01/2010 |
| 2 |  |
26/02/2010 |
| 3 |  |
26/03/2010 |
| 4 |  |
23/04/2010 |
| 5 |  |
28/05/2010 |
| 6 |  |
25/06/2010 |
| 7 |  |
23/07/2010 |
| 8 |  |
27/08/2010 |
| 9 |  |
24/09/2010 |
| 10 |  |
22/10/2010 |
| 11 |  |
26/11/2010 |
| 12 |  |
24/12/2010 |
Blu-ray[]
| Blu-ray | Couverture | Date de sortie japonais |
| 1 |  |
30/03/2012 |